Die S 3  fährt seit ein paar Jahren auch zeitweise von Stade in Niedersachsen   direkt nach Pinneberg in Schleswig-Holstein . Diese Strecke ist 75,3 km lang und die Fahrtzeit beträgt 100 Minuten. Besonders im Berufsverkehr wird sie von Pendlern genutzt und ist damit die am meisten frequentierte  Linie im S- und U -  Bahnnetz